Compañía aérea fundada el 1 de diciembre de 1991 por el gobierno de Estonia a partir de lo que fue la división local Aeroflot. Estonian Air fue la primera aerolínea nacional estatal de Estonia, inmediatamente después del restablecimiento de la independencia del país. En marzo de 2007 la aerolínea anunció que agregaba Viena a sus destinos, además de Tallin, San Petersburgo (Rusia), Kuressaare y Estocolmo.En 1996, el gobierno de Estonia decidió privatizar la línea aérea, y el 66% de las acciones fueron puestas en venta. La compañía aérea danesa Maersk Air, junto con los inversores estoneses de Cresco S.A., ganó el concurso de privatización y, como resultado, el Estado de Estonia quedó propietario del 34% de las acciones, Cresco S.A., del 17% y Maersk Air del 49% de las acciones. En septiembre de 2003, SAS AB firmó en acuerdo con Danish Maersk Air S.A para adquirir un 49% de las acciones de la compañía. Sus rutas son: Estocolmo, Copenhague, Londres, Frankfurt, Hamburgo, Kiev, Moscú, Vilnius, París, Oslo, Berlín y Ámsterdam. Estonian Air vuela a Bruselas en cooperación con SAS y a Riga en cooperativa con AirBaltic y en España sus destinos son Madrid y Barcelona.